ترجمه مقاله صف بندی موازی برنامه نویسی DNA

ترجمه مقاله صف بندی موازی برنامه نویسی DNA

دانلود فایل

ترجمه طلایی مقاله صف بندی موازی برنامه نویسی DNA صف بندی موازی برنامه نویسی DNAچکیده-در این مقاله ما یک الگوریتم موازی جدید پیشنهاد می کنیم که صف بندی بهینه رشته برنامه نویسی DNA مبتنی بر مدل DNA/protein که توسط Hein پیشنهاد شده است را بمنظور تعیین فاصله بین دو رشته برنامه نویسی DNA محاسبه کند. اثبات خواهیم کرد که این الگوریتم نسبت به الگوریتم ترتیبی، از نظر هزینه بهینه بوده و تطبیقی می باشد. الگوریتم موازی اجرا شده و نتایج آزمایشی، کارایی این الگوریتم را نشان خواهد داد. کلیدواژگان: بیوانفورماتیک، الگوریتم های موازی، تنظیمات رشته. Parallel alignment of coding DNAS.H. Alavi-Soltani, H. Ahrabian1, A. Nowzari-DaliniCenter of Excellence in Biomathematics,School of Mathematics, Statistics, and Computer Science,University of Tehran, Tehran, Iran.Email: {alavi,ahrabian,nowzari}@ut.ac.ir. AbstractWe present a new parallel algorithm that computes an optimal alignment of the coding DNA sequences based on DNA/protein model proposed by Hein for the evaluating distance between two coding DNA sequence. The algorithm is proved to be adaptive and cost optimal with respect to the sequential algorithm. The parallel algorithm is implemented and experimental results show the efficiency of algorithm.Keywords: Bioinformatics, Parallel algorithms, Sequence alignments.1 Introduction 1.    مقدمه [Jones و همکارانش، 2004]. صف بندی رشته در رشته های زیستی، تحت عنوان صف بندی شناخته شده اند. برنامه نویسی دینامیکی روش انتخاب نواحی هم جهت شده رشته های DNA و پروتئینی می باشد. برای تعدادی از طرح های امتیازدهی صف بندی، این روش برای تولید یک صف بندی از دو رشته داده شده، با بیشترین احتمال امتیاز تضمین شده می باشد. امتیاز بندی با در نظر گرفتن فواصل بین دو رشته تغییر می یابد. مکانیزم امتیاز دهی برای دو رشته را می توان با سه مدل مختلف طراحی کرد: مدل DNA، مدل پروتئین، مدل پروتئین/DNA. در این مقاله، با مدل پروتئین/DNA سر و کار خواهیم داشت. حال توضیح مختصری در مورد این سه مدل می دهیم.یک روش سرراست، فاصله تکاملی بین دو رشته برنامه نویسی DNA این است که از برنامه نویسی پروتیئن چشم پوشی کرده و فاصله را با استفاده از چند مدل تکاملی DNA محاسبه کند. فاصله تکاملی بین دو رشته در یک مدل سطح DNA را می توان اغلب بصورت مساله صف بندی کلاسیک فرمول نویسی کرده و بصورت کارایی با برنامه نویسی دینامیکی محاسبه کرد [Jones و همکارانش2004؛ Needlman 1970و همکارانش؛ 1980Waterman].معمولا توصیف فاصله تکاملی بر اساس یک صف بندی از پروتئین های رمزگذاری شده نسبت به یک صف بندی تنها بر اساس برنامه نویسی DNA بیشتر قابل اتکا می باشد [Pearson, 1996].

  • پایان نامه آشنایی با عملیات‏های اساسی رگرسیونی در Eviews

    پایان نامه آشنایی با عملیات‏های اساسی رگرسیونی در Eviews دانلود فایل پایان نامه آشنایی با عملیات‏های اساسی رگرسیونی در Eviews (ورود  داده‏ها, ترسیم سری‏های اقتصادی, چگونگی اجرای رگرسیون‏های حداقل مربعات معمولی OLS ) مقدمه بر الگوی رگرسیونی در این فصل…

  • موبایل سیگنالینگ

    موبایل سیگنالینگ دانلود فایل موبایل سیگنالینگ استفاده روز افزون از شبكه های موبایل و افزایش تعداد كاربران در یك ناحیه محدود سبب شده است كه ترافیك سیگنالینگ به طور چشمگیری افزایش یابد . از طرفی وجود مشتركیتی با قابلیت تحرك…

  • پاورپوینت بازیگران و محیط خط مشی

    پاورپوینت بازیگران و محیط خط مشی,دانلود پاورپوینت بازیگران و محیط خط مشی,رسانه های جمعی,ساختار جامعه,ساختار دیوانسالاری,سازمان دولت,سازمانهای تحقیقاتی,طبقه بندی خط مشی,قوه مجریه,قوه مقننه,کارگزاران منتخب,کارگزاران منصوب,گروههای ذینفع,نظام بین اللملی دانلود فایل عنوان: پاورپوینت بازیگران و محیط خط مشی فرمت: پاورپوینت (PowerPoint)…

  • تحقیق مقاله الگوریتم‌های مسیریابی

    الگوریتم‌های مسیریابی,تحقیق الگوریتم‌های مسیریابی,تحقیق مقاله الگوریتم‌های مسیریابی,مقاله الگوریتم‌های مسیریابی دانلود فایل تحقیق و مقاله الگوریتم‌های مسیریابی دارای 200 صوبا فرمت ورد تعداد بازدید : 14567 شنبه 17/5/1388 تاریخ : الگوریتم‌های مسیریابی در شبکه‌های کوچک، و در نقاطی که انتقال اطلاعات…

  • کارآفرینی با کاشت زعفران در منزل

    دانلود,دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پایان نامه,دانلود پرسشنامه,دانلود پروژه,دانلود طرح توجیهی,دانلود فایل,دانلود کتاب,دانلود گزارش کارآموزی,دانلود مقاله,دانلود نرم افزار,دانلود نمونه سوالات,کار در منزل,کارآفرینی با کاشت زعفران در منزل,کسب درآمد اینترنتی دانلود فایل محسوب می شود  افزایش مصارف صنعتی دارویی و 

  • پایان نامه بررسی عزت نفس دانشجویان خود شكوفا در زمینه های ورزش و تحصیل

    پایان نامه بررسی عزت نفس دانشجویان خود شكوفا در زمینه های ورزش و تحصیل دانلود فایل پایان نامه بررسی عزت نفس دانشجویان خود شكوفا در زمینه های ورزش و تحصیل چكیده هدف تحقیق حاضر با عنوان بررسی عزت نفس دانشجویان…

  • تحقیق بدیع در مثنوی (آرایه ادبی)

    بدیع در جلد سوم مثنوی,تحقیق بدیع در مثنوی (آرایه ادبی) دانلود فایل نگاهی به بدیع در جلد سوم مثنوی قسمتهایی از متن: دیباچه مثنوی ، کتابی است تعلیمی و درسی در زمینه عرفان و اصول تصوف و اخلاق و معارف…

  • طرز آماده سازی سکنجبین‌ های دارویی

    دانلود طرز آماده سازی سکنجبین‌ های دارویی,طرز آماده سازی سکنجبین‌ های دارویی دانلود فایل دانلود طرز آماده سازی سکنجبین‌ های دارویی سکنجبین ظاهراً سک انگبین و یا سرکه انگبین بوده است. سک در فارسی به معنای سرکه بوده چنانکه به…

  • بررسی حسابداری سنجش مسئولیت

    بررسی حسابداری سنجش مسئولیت دانلود فایل بررسی حسابداری سنجش مسئولیت مقدمه  یکی از مهم ترین اهداف بنگاه های اقتصادی، کسب انتفاع و افزایش ثروت صاحبان سهام (مالکان) در دراز مدت است. سهامداران، اعتبار دهندگان و دیگر گروههای مرتبط با بنگاه…

  • طرح توجیهی ایجاد واحد تولید شارژ گاز CNG خانگی

    طرح توجیهی ایجاد واحد تولید شارژ گاز CNG خانگی دانلود فایل طرح توجیهی ایجاد واحد تولید شارژ گاز CNG خانگی طرح توجیهی تولید شارژ گاز سی ان جی خانگی CNG ۱۰۰٪ مورد تایید وزارت صنایع و معادن جهت دریافت تسهیلات…

  • ارزشیابی سهام عادی (فصل هفتم کتاب مدیریت سرمایه گذاری تالیف جونز ترجمه تهرانی و نوربخش)

    ارزشیابی سهام عادی (فصل هفتم کتاب مدیریت سرمایه گذاری تالیف جونز ترجمه تهرانی و نوربخش),دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پاورپوینت ارزشیابی سهام عادی (فصل هفتم کتاب مدیریت سرمایه گذاری تالیف جونز ترجمه تهرانی و نوربخش),دانلود پایان نامه,دانلود پایان نامه ارشد,دانلود پایان نامه…

  • طرح توجیهی و کارآفرینی تولیدی لباس کار

    طرح توجیهی و کارآفرینی تولیدی لباس کار دانلود فایل برگزاری اولین مجمع عمومی عادی

  • بررسی قابلیت بهره برداری از نگرش(SOA (Service Oriented Architecture در چارچوب MDA (Model Driver Architecture)

    بررسی قابلیت بهره برداری از نگرش(SOA (Service Oriented Architecture در چارچوب MDA (Model Driver Architecture),دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پایان نامه,دانلود پایان نامه ارشد,دانلود پایان نامه کارشناسی,دانلود پرسش,دانلود پروپوزال,دانلود پروژه,دانلود پروژه پایانی,دانلود تحقیق,دانلود گزارش کار آموزی,دانلود مقاله,دانلود نرم افزار دانلود فایل بررسی…

  • تحقیق ماهی های تزئینی آب شیرین, از شناخت تا تکثیر

    از شناخت تا تکثیر,اسكار,اسکات,پیرانا,تحقیق ماهی های تزئینی آب شیرین,خانواده شارک,خانواده ماهی های سیچلاید,خانواده ماهیهای بارب,دیسكس,سیلور دالر,فلاور هورن,گوارامی,ماهی آنجل,ماهی پرت,ماهی سورم,ماهی نایف (چاقو ماهی ),ماهی های زنده زا دانلود فایل با توجه به گستردگی و تنوع این گونه ماهی ها, این…

  • پاورپوینت مدیریت اسناد و بایگانی

    پاورپوینت مدیریت اسناد و بایگانی دانلود فایل پاورپوینت مدیریت اسناد و بایگانی اسلاید یک مدیریت امور دفتری: مجموعه اصول و روشهایی است که ناظر بر دریافت و ثبت، تهیه و صدور نامه های اداری می باشد و موجب هماهنگی، کنترل…

  • گزارش کاراموزی شركت ماشین كاران نو اندیش (قالب سازی)

    دانلود گزارش کارآموزی شركت ماشین كاران نو اندیش (قالب سازی),شركت,قالب سازی,کاراموزی شركت ماشین كاران نو اندیش (قالب سازی),کارورزی شركت ماشین كاران نو اندیش (قالب سازی),گزارش کاراموزی شركت ماشین كاران نو اندیش (قالب سازی),ماشین كاران نو اندیش دانلود فایل گزارش کاراموزی…

  • سمینار پردازش های قطاری و دم کلفت دررفتارهای انسانی

    سمینار پردازش های قطاری و دم کلفت دررفتارهای انسانی دانلود فایل سمینار  پردازش های  قطاری و دم کلفت دررفتارهای انسانی پویایی بسیاری از پدیده های اجتماعی، اقتصادی و تکنولوژیکی تحت تاثیر اعمال افراد قرار دارند، درک کمی از رفتار انسان…

  • گزارش کارآموزی لیتوگرافی و چاپ

    چاپ,دانلود گزارش کارآموزی لیتوگرافی و چاپ,کاراموزی لیتوگرافی و چاپ,کارورزی لیتوگرافی و چاپ,گزارش کارآموزی لیتوگرافی و چاپ,گزارش کاراموزی لیتوگرافی و چاپ,لیتوگرافی دانلود فایل گزارش کارآموزی لیتوگرافی و چاپ در 62 صفحه ورد قابل ویرایش پیشگفتار معرفت بصری و کلامی  تركیب بندی…

  • پایان نامه بررسی متالوگرافی(آزمایش و بررسی ساختار میكروسكوپی چدن خاكستری كم كربن)

    پایان نامه بررسی متالوگرافی(آزمایش و بررسی ساختار میكروسكوپی چدن خاكستری كم كربن),پروژه بررسی متالوگرافی(آزمایش و بررسی ساختار میكروسكوپی چدن خاكستری كم كربن),تحقیق بررسی متالوگرافی(آزمایش و بررسی ساختار میكروسكوپی چدن خاكستری كم كربن),دانلود پایان نامه بررسی متالوگرا,مقاله بررسی متالوگرافی(آزمایش و بررسی…

  • ترجمه مقاله افزایش شکستکی رشته ی دوتایی DNA، مسئول حساسیت جهش pso3-1 درSaccharomyces cerevisiae به پراکسید هیدروژن می شود

    ترجمه مقاله افزایش شکستکی رشته ی دوتایی DNA، مسئول حساسیت جهش pso3-1 درSaccharomyces cerevisiae به پراکسید هیدروژن می شود دانلود فایل ترجمه مقاله افزایش شکستکی رشته ی  دوتایی DNA، مسئول حساسیت جهش pso3-1 درSaccharomyces cerevisiae به پراکسید هیدروژن می شود…

  • پژوهش بررسی ویژگی های شخصیتی زنان سردمزاج وعادی با آزمون MMPI

    پروژه بررسی ویژگی های شخصیتی زنان سردمزاج وعادی با آزمون MMPI,پژوهش بررسی ویژگی های شخصیتی زنان سردمزاج وعادی با آزمون MMPI,تحقیق بررسی ویژگی های شخصیتی زنان سردمزاج وعادی با آزمون MMPI,دانلود پایان نامه بررسی ویژگی های شخصیتی زنان سردمزاج وعادی…

  • پایان نامه شرح دستگاه آنالایزر

    آنالایزر,پایان نامه شرح دستگاه آنالایزر,پروژه شرح دستگاه آنالایزر,تحقیق شرح دستگاه آنالایزر,دانلود پایان نامه شرح دستگاه آنالایزر,دستگاه,شرح,مقاله شرح دستگاه آنالایزر دانلود فایل پایان نامه شرح دستگاه آنالایزر در 115 صفحه ورد قابل ویرایش  فهرست مطا لب 1- مقدمه 2- بلوك و…

  • زندگی نامه بیدل دهلوی

    زندگی نامه بیدل دهلوی دانلود فایل بخشهایی از متن: درسال 1054 ه . ق در ساحل جنوبی رودخانه «گنگ»  در شهر عظیم آباد پنته «میرزا عبد الخالق»  صوفی سالخورده قادری صاحب فرزند پسری شد، میرزا به عشق مراد معنوی سلسله…

  • تاثیرات تولیدات پراكنده در پایداری سیستم های قدرت ( DG)

    تاثیرات تولیدات پراكنده در پایداری سیستم های قدرت ( DG),دانلود آهنگ,دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پایان نامه,دانلود پرسشنامه,دانلود پروژه,دانلود پروژه تاثیرات تولیدات پراكنده در پایداری سیستم های قدرت ( DG),دانلود سریال,دانلود فایل,دانلود فیلم,دانلود کتاب,دانلود مقاله,دانلود نرم افزار,دانلود نمونه سوالات,کار در منزل,کسب درآمد…

  • مقاله طرح های بازاریابی

    مقاله طرح های بازاریابی دانلود فایل

  • پایان نامه ارزیابی رابطه بین نسبت های مرتبط با قیمت معاملاتی با بازده سهام در شركتهای پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار

    پایان نامه ارزیابی رابطه بین نسبت های مرتبط با قیمت معاملاتی با بازده سهام در شركتهای پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار دانلود فایل پایان نامه ارزیابی رابطه بین نسبت های مرتبط با قیمت معاملاتی با بازده سهام در شركتهای…

  • گزارش کارآموزی بانک رشته حسابداری

    گزارش کارآموزی بانک رشته حسابداری دانلود فایل گزارش کارآموزی بانک  رشته حسابداری  قبل از پیدایش پول در جوامع بشری انسانها برای داد و ستد کالا از کالاهایی استفاده می کردند که نقش واسطه بین کالا ها را ایفا می کرد…

  • بررسی طرح تولید نان های صنعتی و بهبود دهنده ها

    بررسی طرح تولید نان های صنعتی و بهبود دهنده ها,پروژه پایانی دانلود فایل بررسی طرح تولید نان های صنعتی و بهبود دهنده ها فهرست: مقدمه فصل اول: 1ـ معرفی انواع نان های صنعتی 2ـ ویژگی های گندم و آرد مناسب…

  • بررسی اهمیت رضایت مشتری و تاثیر آن در بازار رقابتی

    اهمیت رضایت مشتری و تاثیر آن در بازار رقابتی,بازار رقابتی,بررسی اهمیت رضایت مشتری و تاثیر آن در بازار رقابتی,پایان نامه بررسی اهمیت رضایت مشتری و تاثیر آن در بازار رقابتی,رضایت مشتری,رضایت مشتری و تاثیر آن در بازار رقابتی دانلود فایل…

  • سمینار برق مدار امپدانسی Z SOURCE INVERTER

    سمینار برق مدار امپدانسی Z SOURCE INVERTER دانلود فایل سمینار برق مدار امپدانسی Z SOURCE INVERTER چکیده: در این پروژه از مداری با عنوان مدار امپدانسی z-source inverterو روش کنترلی آن بحث میکنیم . مداری که قابلیت اتصال و کوپل…

  • پایان نامه طـراحـی پستـهای فشـار قـوی (سیستم زمین)

    پایان نامه طـراحـی پستـهای فشـار قـو,پایان نامه طـراحـی پستـهای فشـار قـوی (سیستم زمین),پستـهای فشـار قـوی,طـراحـی پستـهای فشـار قـوی دانلود فایل پایان نامه طـراحـی پستـهای فشـار قـوی (سیستم زمین) قسمتی از متن: اتصال زمین یا ارت     بسیاری از خطرات برای…

  • پاورپوینت تجزیه و تحلیل صنعت

    پاورپوینت تجزیه و تحلیل صنعت دانلود فایل پاورپوینت تجزیه و تحلیل صنعت qمقدمه vدومین مرحله در تحلیل اساسی سهام عادی، تجزیه و تحلیل صنعت است. سرمایه گذاری که تشخیص می دهد اقتصاد و بازار برای سرمایه گذاری جذاب است بایستی…

  • مقاله بررسی تاریخچه سوبسید در ایران

    پروژه بررسی تاریخچه سوبسید در ایران,تحقیق بررسی تاریخچه سوبسید در ایران,دانلود تحقیق بررسی تاریخچه سوبسید در ایران,مقاله بررسی تاریخچه سوبسید در ایران دانلود فایل مقاله بررسی تاریخچه سوبسید در ایران در 16 صفحه ورد قابل ویرایش   تاریخچه و بررسی عملكرد…

  • پایان نامه انتقال داده‌های اطلاعاتی در باند M 433 بین دو میكروكنترلر

    انتقال داده‌های اطلاعاتی در باند M 433 بین دو میكروكنترلر,پایان نامه انتقال داده‌های اطلاعاتی در باند M 433 بین دو میكروكنترلر,پژوهش انتقال داده‌های اطلاعاتی در باند M 433 بین دو میكروكنترلر,دانلود انتقال داده‌های اطلاعاتی در باند M 433 بین دو…

  • احترام به پدر و مادر در اسلام

    احترام به پدر و مادر در اسلام,دانلود آهنگ,دانلود اندروید,دانلود پاورپوینت,دانلود پایان نامه,دانلود پرسشنامه,دانلود پروژه,دانلود سریال,دانلود فایل,دانلود فیلم,دانلود مقاله,دانلود مقاله احترام به پدر و مادر در اسلام,دانلود نرم افزار,دانلود نمونه سوالات,کار در منزل,کسب درآمد اینترنتی دانلود فایل دانلود مقاله احترام به…